Η Πανελλήνια Ομοσπονδία Ειδικού Τεχνικού Εργαστηριακού Προσωπικού (Π.Ο.Ε.Τ.Ε.Π.) των ΑΕΙ ιδρύθηκε το 2001.
Συγκεκριμένα, ο κλάδος του Ειδικού Διοικητικού Τεχνικού Προσωπικού (ΕΔΤΠ) μετονομάστηκε σε Ειδικό Τεχνικό Εργαστηριακό Προσωπικό (ΕΤΕΠ) με τον νόμο 2817/2000, άρθρο 13.
Η Ομοσπονδία δημιουργήθηκε την αμέσως επόμενη χρονιά, το 2001, ως δευτεροβάθμιο συνδικαλιστικό όργανο που εκπροσωπεί τους συλλόγους ΕΤΕΠ των Ελληνικών ΑΕΙ.
Ανώτατο Όργανο της Π.Ο.ΕΤΕΠ είναι το Πανελλαδικό Συνέδριο (Π.Σ.), το οποίο παίρνει αποφάσεις για οποιοδήποτε θέμα του Κλάδου Ε.Τ.Ε.Π. και λειτουργίας της Ομοσπονδίας. Συγκροτείται από εκλεγμένους αντιπροσώπους των Συλλόγων μελών της Π.Ο.ΕΤΕΠ. Το πλήθος αντιπροσώπων κάθε Συλλόγου εξαρτάται από τον αριθμό των μελών του που συμμετέχουν στην εκλογική διαδικασία ανάδειξής τους (αναλογία 1 αντιπρόσωπος ανά 7 ψηφίσαντες).
Η Πανελλαδική Ομοσπονδία Ε.Τ.Ε.Π. διοικείται από εννεαμελές Διοικητικό Συμβούλιο (Δ.Σ.) που εκλέγεται με διετή θητεία από το Πανελλαδικό Συνέδριο.
